其女儿首都医科大学宣武医院神经外科主任医师教授在朋友圈讣告中提到，“遵照父亲的生前遗嘱，不举行遗体告别；遗体捐献给医学研究。”
1954年10月至1971年11月任南京军区卫生部训练处处长、军区总医院院长、军区卫生部副部长、部长、后勤部副政委兼部主任等职；
人民日报社《健康时报》曾报道，两次出任301医院院长，在任内，刘轩亭大胆推出创新措施，让医院的医疗水平提升了一大步。
刘轩亭是山东莱芜人，延安医科大学(中国医科大学的前身)四年制毕业生，从小参加，成了部队的卫生员兼保卫干事。1938年底，刘轩亭作为护卫队警卫兼卫生员，护送山东军区的干部回延安参加党的七大。1940年，被选进延安医科大学，成了该校学龄最大的学生。
毕业后，刘轩亭被分配到太岳军区，到了山西。成为军区直属卫生所所长和卫生学校教务长。期间，在老师们的撮合下，他与洪洞县选派的学员王梅英喜结良缘。王梅英后来成为我国著名的眼科医生。
在任内，刘轩亭大胆推出措施，首先，先与国外“搭上线”，派优秀医生去国外参观、进修，学习先进知识，同时邀请国外专家来华参观。硬件上要过硬，软实力更要跟上，他在医院办学校，培养了一大批优秀的医护人员。
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